FAUNA
La fauna del municipio de Santo Tomás, es igual a la de otros pueblos del Departamento del Atlántico, siendo variada y encontrándose animales domésticos y otros sin domesticar. Entre los domésticos se encuentran las aves de corral como gallinas, palomas, pavos, patos, animales de campo como el asno, mulos, caballos, también crías de cerdo, ganado vacuno, etc., existen en las tierras que bordean los arroyos, la Ciénaga y el Río Magdalena, ofidios venenosos y no venenosos, como cascabeles, víboras, mapanás, corales, etc. En las aguas de la Ciénaga y el Río Magdalena, existe una gran riqueza de especies acuáticas razón por la cual existe la pesca artesanal.
FLORA
La especiales vegetales mas representativas en Santo Tomás son: Las plantas exterofiticas, que tienen la propiedad de adaptarse a estos terrenos salitrosos y semiaridos, entre otros tenemos: Las plantas espinosas, trupillos esta planta es la que mas abund en potreros y a los lados de las carretrea oriental, aromo rastrero, aromo real, zarsa, guamacho, los cactus, carnodes, tunas, piñuelas, matarraton, uvito, guarumo, roble, almendro, ceiba, dividivi, acacias, el mango, camajoru, etc.
A orillas de la ciénaga y el río Magdalena, se encuentran algunos mangles, batatillas enea, entre otros. La mayor parte de estas especies vegetales pierde su follaje en época de sequía para reverdecer en el periodo de lluviosidad.
